เมมเบรนแบบนาโนฟิลเตรชั่นยังคงมีอัตราการไหลของน้ำสูงภายใต้แรงดันการทำงานต่ำ ซึ่งสามารถกำจัดสารอินทรีย์โมเลกุลขนาดใหญ่ ไอออนของโลหะหนัก เกลือที่มีประจุ 2 และ COD ในน้ำได้ส่วนใหญ่ ในขณะที่ยังคงรักษาเกลืออินทรีย์และเกลือที่มีประจุ 1 ประจุที่มีขนาดเล็กกว่าไว้บางส่วน